Русский учёный, преследуемый агентами КГБ, оказывается в месте проведения ядерных испытаний и под влиянием радиации мутирует в кровожадное чудовище.

После поражения их старейшего врага Шредера, семья черепашек распалась. Кроме борьбы за единство семьи их сенсей Сплинтер обеспокоен еще и тем, что в Нью-Йорке происходит что-то странное. Техноиндустриалист Максимилиан Уинтерс готовит армию древних монстров, остановить которую сможет только суперкоманда бойцов ниндзя - Леонардо, Микеланджело, Донателло и Рафаэль! Вместе со своими прежними соратниками Эйприл О'Нил и Кейси Джонсом Черепашки снова в сражаются за свои жизни, им снова предстоит противостоять таинственному клану Фут, поставившему свои собственные способности ниндзя на службу интересам Уинтера.

Индийские йоги научили Фрэнка Чэндлера магии востока, теперь он известен под именем Чанду. Он владеет искусством телепортации, выпадения в астрал, гипноза, а также создавать иллюзии. Вместе с этими сверхъестественными способностями, ему поручено «идти до конца, с молодостью и силой противостоять злу, которое угрожает человечеству».

Работница музея естественной истории, Аша, получила из-за периметра странные образцы почвы — они не загрязнены радиацией, влажны и даже плодородны. Возможно ли это мире после Третьей мировой войны, где на строгом учёте каждая капля? Или правы её начальники и всему виной то, что Аша пренебрегает таблетками для подавления снов?

30 октября 2009 года состоялась премьера нового блокбастера, предсказывающего конец света в 2012 году. Вся съемочная группа пропала без вести еще до показа. У агента Центрального Внеземного Агентства, ведущего расследование, есть все основания полагать, что исчезновение команды напрямую связано с содержанием картины...